与以往赛制相比，今年第二阶段的比赛除了继续保留赛会制比赛之外，还新增了区域主客场比赛。

7月6日至14日，2024 年中青赛U18女子组第二阶段的赛会制比赛将分别在香河和日照两个赛区进行。20支参赛队通过抽签分为4个小组，每组5支球队，进行单循环比赛。

在赛会制比赛结束后，上海U18女足、江苏U18女足、浙江杭州U18女足和上海体校U18女足共4支球队将进行区域主客场比赛。

第二阶段的比赛不淘汰任何球队，所有参赛队均晋级第三阶段。第三阶段比赛仍采用赛会制，决出最后名次。